本发明公开了一种烟气换热器及其在线清洗方法，其中，该烟气换热器包括转子(1)、密封区(3)、原烟道(4)和净烟道(5)，所述原烟道(4)与所述净烟道(5)通过所述密封区(3)分隔开，所述转子(1)上设置有换热元件，所述原烟道(4)与所述净烟道(5)通过所述转子(1)上的换热元件实现换热，所述原烟道(4)的热端和冷端各自设置有至少一个吹灰器(11,12)。使用本发明提供的烟气换热器及其在线清洗方法能够明显的提高脱硫系统设备的安全性和提高脱硫系统运行的经济性，具有广泛的应用和推广价值。