本发明公开了一种判定污水生物处理系统稳定性和污泥健康状态的方法，判定稳定性方法包括：1)测定其呼吸速率现状OUR；2)测定呼吸速率准内源OURq；获得准内源呼吸比，绘制准内源呼吸比变化特性图；3)由变化特性图判定污水生物处理系统是否稳定。污泥健康状态方法包括：1)污泥曝气；2)测定污泥内源呼吸速率OURen，加入氨氮和C源测定污泥总体耗氧速率OURT，获得内源呼吸比；3)由内源呼吸比判定污泥是否健康。本发明可有效判定污水生物处理系统的稳定性及污泥的健康状态。通过此方法可对污水生物处理系统是否稳定以及污泥是否健康作出快速判定。