本发明提供了一种孤立微电网混合储能优化配置方法，其对微电网电源负荷不平衡功率以及微电网中总负荷加以整体考虑，还综合考虑了系统中间歇性能源和负荷情况随时间波动的因素对微电网混合储能容量配置的影响，建立孤立微电网混合储能容量优化配置，采用遗传算法分别对电源负荷不平衡功率在不同拆分分解形式下对应的孤立微电网混合储能容量优化配置模型进行求解，择优确定更加符合实际的孤立微电网的混合储能最优配置方案，更好地满足实际孤立微电网的混合储能配置规划需求，从而帮助提高孤立微电网混合储能容量配置的利用率和使用寿命，提高运行经济性，降低孤立微电网系统的综合利用成本，能够广泛应用于微电网中混合储能的容量优化配置中。