本发明涉及一种岸电电源系统控制方法，包括如下步骤：1)：双向AC/DC变流器持续检测交流电网的电压，判断岸电电源系统是否处于正常运行状态；正常运行则双向AC/DC变流器控制直流母线电压稳定；否则转到步骤2)；2)：双向AC/DC变流器停止对直流母线电压的稳定控制，并向双向DC/DC变换器发送离网运行指令，使其控制直流母线电压稳定，同时还检测交流电网电压，恢复正常则转到步骤3)，否则持续运行步骤2)；步骤3)：双向AC/DC变流器重新恢复对直流母线电压的稳定控制，双向DC/DC变换器退出对直流母线电压的稳定控制。本发明能有效避免现有交流微电网岸电电源系统在离网转并网时存在的电压频率和相位同步问题，简化系统控制的复杂性，提高其可靠性。