本发明提出了一种栀子中提取纯化栀子黄色素的方法，包括以下步骤：1)取干燥栀子果实，剥壳粉碎后作为提取原料，然后放入提取罐中搅拌采用罐组式动态逆流提取方法进行提取，将提取得到的提取液经浓缩罐浓缩得浸膏；2)将步骤1)得到的浸膏溶于水中，然后上聚酰胺树脂柱吸附洗脱并收集洗脱液，将收集后的洗脱液进行浓缩得到浓缩液；3)将步骤2)得到的浓缩液上大孔吸附树脂柱吸附洗脱并收集洗脱液，将收集后的洗脱液进行浓缩至稠膏，烘干，得栀子黄色素纯品；以上百分数均是质量百分数。该方法采用罐组式动态逆流提取方法进行提取，提取率提高了30％，再通过聚酰胺树脂柱子吸附与大孔吸附树脂柱子进行富集，得到色价大于800的栀子黄色素。