一种基于QTL-seq发掘东乡野生稻耐冷基因的方法
摘要:
本发明公开了一种基于QTL‑seq发掘东乡野生稻耐冷基因的方法。本发明以栽培稻‘协青早B’为受体亲本为母本,东乡野生稻为父本,远缘杂交后连续回交自交获得的重组自交系BC1F10进行耐冷鉴定,获得20耐冷株系组成耐冷基因池,20个冷敏感株系组成的冷敏感基因池。对两个基因池进行高通量测序及QTL‑seq分析,获得两个基因池的差异SNP标记和耐冷性状相关的QTL位点,对候选耐冷基因进行荧光定量PCR检测,最后鉴定检测到东乡野生稻中有5个耐冷相关基因。本发明可快速准确地探明和发掘东乡野生稻耐冷基因,可为全面阐明东乡野生稻耐冷性状的遗传机理提供有力证据,为东乡野生稻耐冷基因的克隆、功能分析奠定基础,促进东乡野生稻耐冷基因用于育种实践。
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