本发明公开了一种结构光三维扫描系统的标定方法及装置，该方法包括：根据初始标定参数，对标定平面扫描，得到标定平面的三维点云数据；标定平面上设置有多个均匀分布的标记点；根据第一指标、第二指标和第三指标与标定参数的关系，找到最优标定参数；第一指标为：根据标记点对应的三维点云数据，计算得到的每相临两个标记点之间的距离与实际距离差异的平均值；第二指标为：根据标记点对应的三维点云数据，计算得到的每个标记点和它相临的两个标记点连接形成的两条直线之间的夹角角度与实际夹角角度差异的平均值；第三指标为：根据标定平面的三维点云数据，计算得到的标定平面的平面度与实际平面度的差异。上述技术方案提高了标定结果的准确性。