本发明公开了一种整车状态下的电池健康状态估算方法及系统，所述方法包括：S1、获取电池包在当前充电过程中的充电容量信息；S2、获取电池包的实际容量信息，及与当前充电过程中电压范围对应的目标实际容量信息；S3、根据充电容量信息、实际容量信息和目标实际容量信息确定电池包在当前充电过程中的估算容量信息；S4、利用当前充电过程中的估算容量信息及前N次充电过程中的估算容量信息，计算电池包的最终实际容量信息；其中，N为正整数；S5、根据最终实际容量信息和电池包的额定容量信息确定电池包当前的电池健康状态；可见，在本实施例中，通过电池实际容量可以精确的反映电池当前健康状态，进一步增进锂离子电池的安全使用。