本发明涉及生物浸钪过程中一种新的浸出方法，将含钪矿物粉粹至一定粒度颗粒，由矿浆投料口加入矿浆池，无需灭菌，取营养培养基在常规发酵罐中进行蒸汽灭菌后，由无菌投料口加入细菌培养池，接种浸钪菌种后，开始浸出；浸出过程中，矿物与细菌通过半透膜分离开，浸钪菌种无需承受剪切力，浸钪菌种分泌的各种有机酸，通过半透膜由细菌培养池进入矿浆池，与矿物发生间接作用，使得钪金属得以浸出；矿物因未与细菌直接接触，不再需要灭菌耗能；浸出后的矿浆经矿浆出料口流出，再经固液分离，得到含钪浸出液，经常规萃取、洗涤、反萃，得到钪的初级富集物；本发明提高了菌种的生长效率，简化了操作流程，降低了运行成本。