本发明设计实现了一种超特高压输电工程线路直击导线的雷电流反演方法及系统，通过建立仿真模型，完全模拟超特高压输电工程线路的实际运行情况，并在固定仿真模型的波阻抗参数、运行方式、雷击位置之后，通过本发明中涉及的反演方法由仿真模型下的仿真雷电流得出实际雷电流的波头时间和幅值。同时，根据实际线路中受到雷击后是否具有跳闸情况，在仿真模型上施加不同大小的仿真雷电流，节省了判断的时间。本发明中设计的反演方法易于操作实现，运算量低，且考虑到超特高压输电工程线路下变电站的运行方式、设备参数、雷击位置、雷电流的波头时间和幅值等各方面信息，可准确划定实际线路下雷电流参数，为后续工作日工便利。