一株异养硝化‑好氧反硝化细菌及其应用，属于微生物领域，所述细菌为麦氏交替单胞菌SLNX2，于2015年11月27日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏号：CGMCC NO.11757。本发明还提供一种利用所述细菌对养殖废水进行净化的方法，所述方法具体为：3株异养硝化‑好氧反硝化细菌在鱼类养殖水体中添加的终浓度控制在1.3×106CFU·mL‑1；所述方法三株复合施加净化效果优于单株效果，使养殖过程中水体氨氮、亚硝酸氮、硝酸氮、总氮和化学需氧量均低于不加菌的对照组，最大可分别低68.55％、48.36％、58.38％、40.02％、27.47％。