本发明提出了柔性导管，包括用以传输微波能量的微波导管以及用以传输光能的导光光纤；本发明提出了复合能量源，包括光源模组、固态微波源模组、散热系统；本发明提出了多功能理疗系统，包括柔性导管、复合能量源、控制模块，所述控制模块用以控制复合能量源的工作策略，所述柔性导管用以传输复合能量源发出的能量。本发明提供的应用于多功能理疗系统的柔性导管、复合能量源以及多功能理疗系统，结合光子治疗仪器、微波治疗仪器的特点和优势，采用多模态一体式柔性导管的形式，即同一柔性导管内集成了用于传输光能的光纤和传输微波的波导管，满足软管介入针对人体内部特定区域进行综合性理疗的需求。