本发明提供了一种基于细胞的比较器及应用与细胞计算机，涉及细胞计算机技术领域，本发明提供的基于细胞的比较器，可对三种特定物质进行大小比较，其结构包括基因表达抑制系统，启动子及启动子控制的信号输出分子。本发明提供的基于细胞的比较器，利用细胞具备丰富多样的信息处理机制的特点，通过抑制基因表达进行计算，用颜色来表征输入物质的大小，更加直观、准确。同时，本发明提供的基于细胞的比较器，通过更换与输入物质相对应的启动子，即可对其他物质进行大小比较计算，具有使用方便、实用性强的优点。