本发明公开了一种应用于城市轨道交通的智能电动风阀控制系统及方法，包括线路中央级监控系统、站级控制器、上位监控系统控制器、智能电动风阀控制箱、智能电动风机控制箱、网络通信总线；所述智能电动风阀控制箱内设有智能电动风阀控制器，所述智能电动风阀控制器电性连接有若干中间继电器，所述中间继电器电性连接有风阀执行器，所述风阀执行器连接有电动风阀，所述智能电动风阀控制器还通信连接有显示器。本发明能节省配电回路数量和电缆数量，并且电动风阀控制箱内元件少、接线简单，从而能极大限度地减少车站土建规模，便于实现风阀能源和电能质量管理，便于风阀的运营维护。