基于DNA条形码的长毛明对虾和凡纳滨对虾的鉴定方法，根据长毛明对虾和凡纳滨对虾线粒体基因组全序列，设计扩增细胞色素C氧化酶I(COI)基因片段的引物COIF和COIR；提取长毛明对虾和凡纳滨对虾的基因组DNA，利用引物COIF和COIR进行PCR反应；将PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测，测序验证；利用MEGA7.0比对获得的序列，利用DNAMAN预测各种对虾代表序列的酶切位点；取待放流的长毛明对虾F1代仔虾和亲虾，提取基因组DNA；利用COIF和COIR，对DNA模板F1～F4，P1～P4，V1，V2，Y1，Y2，V1+Y1，V2+Y2进行PCR扩增，将PCR扩增产物酶切，酶切产物进行电泳鉴定。