本发明公开一种特高压直流发生器的两级调压控制器，包括：整流器用于将三相交流电源整流成直流电源；滤波器用于对整流后得到的直流电源进行滤波；逆变器用于将滤波后的直流电源转化成交流电；中频变压器用于将交流电变压成高压交流电；倍压电路用于对变压后的高压交流电进行整流并倍压成高压直流输出；高压检测回路用于检测高压直流回路；低压检测回路用于检测中频变压器进行变压之前的低压交流回路；保护回路用于当低压交流回路或高压直流回路短路或过载时，立即闭锁控制信号输出；控制器用于根据高压直流回路的检测信号，并利用基于BP神经神经网络的PID调节算法控制整流器的输出。本发明结合BP神经网络技术进行控制，提高输出电压的稳定性。