本发明公开了一种辣木截根菌根化育苗的方法，包括苗床准备、种子选择及处理、沙床催芽、基质制备、芽苗接种及移栽、苗期管理工序，通过选择成熟饱满的辣木种子，经杀虫、消毒处理后进行沙藏催芽，待芽苗长出后进行切根接菌种，再移栽至备好的育苗容器中，通过管护培育出辣木优质壮苗。本发明的截根菌根化育苗的方法，经过种子处理、沙藏催芽、容器育苗等工序，并在移栽前用特制的菌根剂进行蘸根处理，有效提高了苗木的产量和质量，增强了苗木的抗病虫害能力，苗木成活率高，达到95%以上；苗木根系发达，可提前出圃，缩短育苗周期，可降低育苗成本，具有较好的经济效益、社会效益和生态效益。