本发明提供一种基于边界融合的电网状态估计系统及方法，涉及电网状态估计技术领域。系统包括获取各节点的量测量的电网数据采集模块以及包括本地数据单元、状态估计单元的通信模块及数据融合模块，状态估计单元包括存储有基于边界融合的状态估计程序的存储器和显示程序运行输出状态变量的显示器；状态估计程序被执行以便实现基于边界融合的电网状态估计；估计方法为，对区域电网的划分后，建立各区域的量测方程，求取内部量和边界量，对两区域的边界量进行融合后修正边界量，对中间变量进行非线性变换后以最小二乘法求取其状态变量的估计值并输出。本发明系统通信量少，状态估计方法在不失准确性的情况下，提高了电网状态估计的运算速度。