本发明公开了一种基于数字PCR方法检测肉制品中羊源性成分含量的方法。该方法应用生物信息学手段，从15种动物基因组序列中筛选单拷贝基因序列，设计内参引物和羊源种属特异性引物。该方法基于微滴数字PCR技术对肉制品中的羊源性成分含量进行绝对定量分析，无需标准品，无需构建标准曲线，弥补了部分标准品不易获取的缺陷，同时也有效避免了标准品与样品之间的工艺差异产生的量值偏差，进而应用内参基因校正羊源种属特异性基因的百分含量，获得真实可信的食品掺假数值。本发明的检测方法在3h之内即可完成羊源性成分含量鉴定工作，具有简单易行、高效灵敏等特点，为动物源成分量化掺伪鉴定开辟了广阔前景。