本发明提供了一种阿伐那非中间体的制备方法，包括：将起始原料4-(3-氯-4-甲氧基苄基氨基)5-乙氧基羰基-2-甲硫基嘧啶溶于反应溶剂；加入金属卟啉作为催化剂，充分搅拌使分散均匀，转移至反应釜中；在室温条件下通入氧化性气体搅拌反应制备4-(3-氯-4-甲氧基苄基氨基)5-乙氧基羰基-2-甲基亚磺酰嘧啶。本发明方法以取代金属卟啉作为催化剂，以空气或者氧气作为氧化剂，在常温条件下催化氧化硫醚化合物制备阿伐那非的亚砜中间体,反应结束后目标产物与催化剂易于分离，具有收率高、纯度好等特点，大大降低了后期产物分离提纯的难度，回收催化剂可以循环利用，能够显著地降低制备成本。