本发明公开了基于选择谐波消除脉宽调制的直流母线电压波动采样方法，其具体涉及的是三相交流电机驱动系统的控制；方法首先根据各种不同分频数时SHEPWM开关角度分布特性，确定同步处理区间；之后根据母线波动的周期性，使用重复预测器生成的滑动预测窗口对下一个处理区间内的直流母线电压波形进行预测；之后根据预测的母线电压波形与开关时刻估计下一个处理区间内的磁链误差，并相应地调整开关时刻以消除磁链误差；本发明中提出的方法能够保留SHEPWM的优良谐波特性，生成滑动预测窗口，得以在任意时刻预测出从该时刻开始将来一段时间内母线电压的波形，为补偿的实施提供条件。