本发明涉及一种血清中鲍曼不动杆菌的快速鉴定方法及其应用，该方法不依赖血清样本的核酸提取，通过qPCR检测噬菌体侵染病原菌后产生子代噬菌体的核酸拷贝数的变化，实现病原菌鲍曼不动杆菌的快速鉴定。该方法使用的特异性引物和探针，是通过分析噬菌体和鲍曼不动杆菌的序列并找出噬菌体的特异序列，针对该特异序列设计的，所述引物包括正向引物和反向引物，所述引物序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示，所述探针序列如SEQ ID NO.3所示。该引物和探针应用于本发明的快速鉴定方法，噬菌体检测方法的特异性强。本发明的血清中鲍曼不动杆菌的鉴定方法以噬菌体核酸序列为靶标，能在4h内实现对鲍曼不动杆菌低至102CFU/mL的检测，检测方法简单易操作，检测灵敏度高。