本发明公开了一种基于软件实现的卫星故障诊断方法，包括如下步骤：步骤一、地面站向卫星发送包含故障诊断信息的注数；步骤二、星载计算机软件对接收到的注数进行合法性判断，如果合法则进入步骤三、否则丢弃注数，不作处理；步骤三、星载计算机软件进入故障诊断遥测模式，向地面下传故障诊断包直至完成所有故障诊断包的下传。本发明提出的方法，不影响现有的遥测模式，实现了对卫星工作状态或者故障的详细诊断，显著提高了卫星的可用性、可维护性，对延长卫星的寿命具有积极的作用。此外，该方法灵活实用，易于在工程实践中实施运用。