本发明涉及防治线虫病的生防菌株SFC-3及其应用，可有效解决现有防治根结线虫病害的生防菌株存在防效不稳定、使用成本高的问题，其分类命名为棘孢木霉（Trichoderma asperellum），保藏编号为：CGMCC NO.16097，生防菌株SFC-3在浓度为1×109CFU/mL下，对根结线虫虫卵孵化和二龄幼虫都有很好的抑制作用；该菌株能显著降低线虫的入侵，对根结线虫病害的防治效果为78.51%，本发明菌株可以在蔬菜幼苗移栽时灌根使用，且有促生作用。