本发明涉及一种微波加热干燥设备，包括升降机构以及微波烘干机构，用于盛装物料且顶部为开口结构的工作箱，以及用于将工作箱输送至升降机构的输送辊道，微波烘干机构具有微波发生器、微波罩和连接微波发生器与微波罩的微波导管，微波罩的下部为微波出口；输送辊道设置在升降机构上，并能够跟随升降机构进行上下运动；升降机构设置在微波罩的下方，其用于将装载有物料的工作箱顶升，以使工作箱顶部的开口与微波出口接触，并且工作箱顶部的开口与微波出口之间设置有防止微波泄漏的第一密封结构。该微波加热干燥设备妥善解决了微波固化过程中的微波泄漏问题，同时提高了设备的利用率和加热干燥效率。本发明还公开了一种微波加热干燥方法。