本发明涉及一种隧道二衬裂缝处理钻孔孔位检测工具及其工作方法，包括测量装置、入孔装置、固定装置：测量装置包括由后至前依次设置的测角标尺、第一水平标尺、第二水平标尺、第三水平标尺，测角标尺用以测量斜孔的倾角，第一水平标尺、第二水平标尺、第三水平标尺用以测量钻孔与裂缝之间的水平距离；入孔装置包括横截面为正方形，并且上下两端固定设有限位端头的深度标尺，深度标尺用以测量钻孔的深度；固定装置包括滑座、固定座、滑板、卡板、调节螺母，用以固定本工具。本发明的一种隧道二衬裂缝处理钻孔孔位检测工具及其工作方法，精确测量钻孔与裂缝水平距离、斜孔倾角、钻孔深度，计算出孔位是否穿过裂缝，提高钻孔孔位的质量和施工效率。