本发明公开了一种船舶应急照明控制器及其控制方法，所述控制器包括第一数据隔离模块、与第一数据隔离模块相连接的CAN总线数据收发模块，与CAN总线数据收发模块连接的控制器模块，与控制器模块分别连接的应急照明灯切换模块、485总线数据收发模块和数据采集模块，与485总线数据收发模块连接的第二数据隔离模块，电源模块分别其他各模块分别连接。所述控制方法是数据采集模块对照明灯的工作状态进行监测，控制器将监测数据利用卡尔曼滤波数据融合算法进行滤波分析，得到精度高、噪声小以及更加平稳的数据值，可对出现故障的照明灯进行高效、准确检测，实现对应急照明灯的控制管理。