本发明涉及微纳多级有机硅材料领域，公开了一种具有‘草莓状’核壳结构的聚倍半硅氧烷微球材料及其制备方法。包括以下工艺步骤：将两种混合硅烷在表面活性剂，稳定剂，纳米级微球模板的辅助下，在酸或碱催化作用下水解缩合反应，产物经干燥处理后得到微纳多级聚倍半硅氧烷多孔有机硅材料。本发明的优点是通过含有两种不同有机基团的硅烷在不同添加剂作用下获得纳米结构在微米结构上的微纳多级多孔有机硅材料，该微纳多孔结构材料可用做液相色谱分离柱固相成分或聚合物材料的增强用填料。