本发明公开了一种微流控芯片的驱动方法及其装置、微流控系统。该方法可以通过与当前承载有液滴的第一电极连接的第一开关电路，控制该第一电极先与第一电源端导通，并在控制第一电极与第一电源端导通第一时长后，控制第一电极与第二电源端导通第二时长，并在该第二时长后继续控制第一电极与两个电源端均保持断开连接的状态。由于可以先控制第一电极与第二电源端导通第二时长，实现电荷释放；然后再控制第一电极与两个电源端均保持断开连接的状态，使得第一电极上可以残留有部分电荷。因此相对于相关技术中，该方法可以使得相邻两个电极之间的电势差减小，进而避免了相邻两个电极由于电势差相差较大而容易发生高压击穿的现象。