本发明涉及一种用于兼容核磁共振的微波消融仪辅助系统，所述的微波消融仪设有仪表操作面、电源开关、水循环开关、水冷管、电源接口、及微波输出端口；其特征在于：所述用于兼容核磁共振的微波消融仪辅助系统包括内部能容置所述的微波消融仪的外罩体。将现有的微波消融仪罩设在外罩体内，能消除微波消融仪对核磁共振系统的产生磁性影响，不会对磁共振成像产生影响，从而与磁共振成像系统能兼容。采用该系统，不用对现有的微波消融仪进行改进，只需要将现有的微波消融仪放在该系统内，就能对核磁共振系统兼容。该辅助系统结构简单，操作方便。