本发明涉及一种植物绿色秸秆快速腐解并防控烤烟根结线虫病的方法，该方法选择具有抗根结线虫病基因的油萝卜作为绿肥的绿色秸秆，筛选对根结线虫病具有防控效果、兼顾高效腐解绿色秸秆的四种微生物，以四种菌剂的适宜浓度和配比，在盛花期喷施腐解菌剂，进一步将喷施菌剂的绿色秸秆就地翻埋腐解60天以上，通过促进绿色秸秆快速和高效腐解，在减施30％化肥的条件下，烤烟栽培根际土壤的有机质快速降解，氮磷钾主要养分充足；对烤烟栽培过程中的根结线虫病防控效果显著；烟叶产值量明显提高。本发明是一种对绿色秸秆快速腐解、有效增加土壤有机质和土壤养分、防控下一茬栽培作物中根结线虫病、提高作物产量与品质的简便方法。