本发明涉及一种液化天然气船用聚氨酯绝缘箱的制造方法及制造系统，制造方法包括胶接装配阶段、整平输出阶段、CNC加工阶段及包装阶段，胶接装配阶段包括通用胶接装配过程、压合过程及时效过程；系统包括通用胶接装配区、MARK III二次胶接装配区、压合区、时效区、整平输出区、CNC加工区及包装区。与现有技术相比，本发明利用自动化设备高效率的优点，按照加工过程的属性设定功能区块，区块内的各工位通过自动物流输送线相连接，各区块之间则通过智能传输系统进行衔接，使其能够连续、高效、有序的运转，将会最大限度的发挥各区块的功能，降低单一设备故障对整个生产系统的影响，提高生产效率、缩短生产工时、保证产品高精度的质量要求。