本发明公开了一种变频太阳能热泵热水器控制方法及系统，包括以下步骤：系统运行参数初始化步骤，包括：（11）、根据初始太阳辐照强度值和初始环境温度，获取初始最佳运行时间，以及初始平均制热功率；（12）、根据所述初始平均制热功率计算压缩机的初始运行频率和电子膨胀阀初始开度；按照压缩机的初始运行频率和电子膨胀阀初始开度运行系统，系统运行过程中周期性调整压缩机运行频率和电子膨胀阀开度。本方法利用太阳能辐射热量来提高蒸发器热量的吸收，又利用空气热量来弥补太阳能辐射热量的不稳定性，使太阳能空气能双源合一达到提升太阳能热水器系统性能的目的。