本发明公开了一种透明模型箱底座与振动台螺孔精确定位装置及使用方法，装置包括龙门梁、龙门基座、激光对中结构；龙门基座成对设置，位于透明模型箱的两个相对侧边上或两个相对侧边的外侧，用于支撑所述龙门梁；龙门梁滑动连接安装在所述龙门基座上，能够沿透明模型箱对应侧边长度方向来回移动；龙门梁上设置有沿龙门梁长度方向布置的刻度；龙门梁上设置有若干个可沿龙门梁长度方向移动的激光对中结构；激光对中结构包括激光器和刻度指针，所述激光器用于发射可见激光并投射在透明模型箱底座上，用于实现透明模型箱底座与振动台螺孔的初定位；通过所述刻度指针配合龙门梁上的刻度，实现透明模型箱底座与振动台螺孔的精确定位。