本发明公开了一种发动机风扇后运行控制方法、系统及电子设备，该方法包括：采集车辆停车熄火前的运行参数；获取与每个所述运行参数相对应的后运行请求等级；获取与等级高的后运行请求等级相对应的占空比调整策略；根据所述占空比调整策略，调整发动机风扇在不同后运行时间段内的占空比。本发明根据已进行的后运行时间调整风扇占空比，可以有效减小发动机排气温度对周边零部件的劣化影响，减小停车熄火后发动机排气温度的热害影响，降低风扇能耗以及停车熄火后的风扇噪声。