本发明公开了一种基于卷积神经网络识别信号调制方式的方法及系统，属于信号检测与识别技术领域。本发明方法，包括：对信号源发出的两路无噪信号的其中一路无噪信号加入噪声；生成高阶累积量和二维矩阵作为训练标签，生成高阶累积量和二维矩阵作为数据输入量；获取多个去噪特征模型，生成识别模型；获取信号源发出的信号，提取I/Q信息，截断I/Q信息的高阶累积量并生成二维矩阵，将二维矩阵送入识别模型中对信号进行调制识别并输出信号调制方式。本发明提高了分类器的泛化能力和识别准确率；降低了实际接收信号样本数，利用无监督去噪声自编码有效抑制噪声的影响，提高最终识别模型的准确率。