本发明公开了一种微藻油改性橡胶沥青的制备方法，是由原料基质沥青、橡胶粉、微藻油和裂解剂制备而成：首先将基质沥青加热到160~170℃，然后将橡胶粉和裂解剂缓慢加入到基质沥青中，在180~185℃温度下以3500~4000r/min的高速剪切搅拌60~90min，然后在160~170℃下以500~1000 r/min低速搅拌发育40~60min，得到胶粉改性沥青；将微藻油预热至160~170℃，胶粉改性沥青预热至160~170℃，然后将微藻油缓慢加入到胶粉改性沥青中，在160~170℃温度下以3500~4000r/min的高速剪切搅拌10~30min，得到微藻油改性橡胶沥青成品；本发明采用微藻油对橡胶沥青进行改性，微藻油中的石沥青成分可显著提升脱硫橡胶沥青的高温性能，其余的低黏成分亦可改善脱硫橡胶沥青黏度过高的问题。