本发明提供一种基于二氧化锰纳米花和荧光材料的微生物检测方法，包括：先将二氧化锰纳米花和荧光材料结合得到二氧化锰纳米花‑荧光材料复合体，使荧光材料的荧光猝灭，再将二氧化锰纳米花‑荧光材料复合体与目标微生物结合，得到目标微生物‑二氧化锰纳米花‑荧光材料复合体，然后还原目标微生物‑二氧化锰纳米花‑荧光材料复合体中的二氧化锰，使荧光材料被释放出来，在外界激发条件下重新发射荧光，最后测量荧光强度计算目标微生物浓度。本发明利用二氧化锰纳米花和荧光材料之间能量转移，使荧光材料荧光猝灭，再将二氧化锰还原为锰离子，将荧光材料释放出来可重新发射荧光，同时利用纳米花的高负载特性，进行信号放大，实现微生物的灵敏检测。