本公开提供了一种爆珠滤棒端部密度数据修正方法及系统，获取滤棒的微波法测量值；选取备用数据；计算各测量单元密度值的平均值，计算各平均值的平均值、标准偏差和可能出现的最小值，根据计算值确定其中的失真、待修正测量单元；以滤棒测量起始端或/和末端第一个不失真测量单元检测值组成的数组为因变量，以滤棒测量起始端或/和末端第一个失真测量单元检测值组成的数组为自变量，进行回归分析，得到的回归函数作为该失真、待修正测量单元的初步修正数学模型，并进行修正；记录修正后的检测值，重新构造自变量和因变量，进行回归分析，得到回归函数和决定系数，确定决定系数最大时对应的回归函数为该失真、待修正测量单元的修正数学模型，按照修正数学模型进行数据修正。