本申请提供的基于可编辑逻辑器件的SPWM同步脉冲生成电路、方法及系统，通过控制算法锁定牵引电网相位，实现了列车级别的脉冲同步；通过同一变压器下不同控制器之间的主从模式和外部同步信号，实现了变压器级别的脉冲同步；通过DSP和FPGA之间的载波同步脉冲实现了变流器级别的脉冲同步，克服了多台控制器之间时钟不同步、DSP与FPGA芯片时钟不同步问题，消除了载波、调制波信号不同步产生的累积误差，解决了变流器功率器件的“丢脉冲”问题，提高了轨道机车车辆运行的稳定性。