本发明公开一种综合能源系统运行模式平滑切换控制方法和装置，方法包括：响应于综合能源系统需要进行运行模式切换，执行以下操作：首先获取综合能源系统当前设备参数；然后基于当前设备参数，利用预先构建的期望运行模式优化模求解得到相应的期望运行状态数据；再计算由当前运行状态切换至期望运行状态的期望过渡时间；然后基于当前时刻的当前运行状态数据与期望过渡时间截止时刻的期望运行状态数据，构建系统运行状态数据与时间之间的一元线性回归方程；最后根据所述一元线性回归方程确定综合能源系统在期望过渡时间内各时间点的运行状态数据，并控制相应设备的运行，直至综合能源系统运行模式切换完成。本发明能够实现两种运行模式的平滑过渡，减少模式切换对综合能源系统的冲击。