本发明公开了一种长筒石蒜LlDFRc基因及其表达的蛋白和应用，属于植物分子生物学领域，LlDFRc基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其表达蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。LlDFRc基因是花青素合成下游途径中重要的调控基因，在石蒜初蕾期表达活跃，而后随花开放，表达量降低，能使其遗传转化的烟草花色加深，由粉红转至浅红，是一种可以改变花色的DFR基因。将LlDFRc基因应用于转基因植物，可改良植物的花色从而提高其观赏性，具有实际应用价值。