本发明提供一种智能告警处理方法及配网主站系统，属于配电网领域。获取原始告警信息；利用智能告警规则库中的智能告警类型匹配规则判断与原始告警信息对应的已建立的智能告警类型集合中的各智能告警类型是否匹配，将匹配成功的智能告警类型作为原始告警信息对应的智能告警事件；原始告警信息对应的智能告警事件与已有智能告警事件均不属于同一原因的告警事件时，生成新的智能告警事件；利用匹配成功的智能告警类型对应的预备规则得到新的智能告警事件对应的二级动态规则，将其添加到二级动态规则库中作为新的智能告警事件的临时分析策略。本发明能处理新的智能告警类型和适应智能告警分析需求的变化。