本发明公开了一种面向船舶的光伏发电系统最大功率点跟踪控制方法，主要用于抑制船舶光伏系统运行过程中出现的各类扰动问题。本方法将光伏阵列分割为大小不等的若干组，每一组内的光伏电池板以全交叉形式连接，各组的大小及内部结构可根据实际情况灵活布局；对于每一组电池板内部，按遮阴程度细分为未遮阴、轻度遮阴、中度遮阴以及重度遮阴等类别，并建立基于神经网络的最大功率点离线及在线混合预测模型：由离线模型快速实现最大功率点的粗调，再由在线算法实现精调；光伏系统的实际运行数据通过反馈不断修正神经网络模型，且通过添加适当长度的时间窗对反馈数据的时效性进行限制，从而提升光伏系统在船舶特殊应用环境下的最大功率点跟踪精度。