本发明公开了一种分布式发电项目优化配置方法，属于新能源发电优化配置技术领域，包括：建立分布式发电商响应行为模型；建立电力用户响应行为模型；建立电网企业响应行为模型；采用多下层双层规划模型转换方法将上述响应行为模型转化为单层多目标优化模型；利用多目标进化算法求解单层多目标优化模型，得到分布式发电市场化环境下各交易主体的行为决策结果。本发明方法结合分布式发电市场化相关政策及规范约束，建立各交易主体响应行为模型，可以切实反映分布式发电市场化环境中各主体利益诉求及行为模式，采用本发明方法得到的各主体行为决策结果更符合实际工程需求，有利于提高分布式发电市场运行的安全性和经济性。