本发明提供了一种表达芳樟醇合成酶的融合基因及其应用，涉及代谢工程菌技术领域，所述融合基因自5’端至3’端依次包括启动子‑核糖体结合位点RBS‑融合标签‑芳樟醇合成酶基因bLIS。本发明利用所述融合基因构建了多种不同的重组表达载体，并转化具有GPP合成能力的大肠杆菌，构建工程菌。经验证，所述融合基因、重组表达载体可显著提高芳樟醇合成酶的表达量和可溶性表达，将改造的重组表达载体转入具有GPP合成能力的大肠杆菌重组菌，可有效提高生产菌的芳樟醇产量，在芳樟醇的生物合成过程中具有广泛的应用前景。