本发明涉及一种基于邻接矩阵的行星轮系同构判定方法、系统和介质，获取两个行星轮系的3D模型图，对每个3D模型图分别进行简化，得到两个行星轮系的简化拓扑图；按照预设的邻接矩阵定义，根据每个简化拓扑图生成对应的行星轮系的邻接矩阵；根据每个邻接矩阵依次获取对应的行星轮系的构件数据、运动副数数据和特征数据，并依次判断两个行星轮系的构件数据、运动副数数据和特征数据是否均对应相同，若是，则两个行星轮系同构，若否，则两个行星轮系异构。本发明基于改进的邻接矩阵，通过简单的计算即可对行星轮系的同构问题进行判定，简便高效，时间复杂度小，能够同时兼顾判别的可靠性、计算简单、计算量少和直观性，适用范围广泛。