本发明涉及污水处理技术领域，特别公开了一种水处理复合活性菌剂及其应用。该水处理复合活性菌剂，其特征在于：包括混合为一体的复合菌群和诱导基，其中，复合菌群由硝化细菌、反硝化细菌、芽孢杆菌属、假单胞菌属、活化酶、光合细菌、甘度菌种属组成；诱导基由氨基酸、酵母提取物、甲壳素、壳寡糖、葡萄糖组成。本发明产品制备简单，生产成本低，菌群生存能力强，易培养、繁殖快，对环境有较强的适应能力和自然进化等特性，符合污水处理的需求，适用性强。