本发明涉及电动机传动技术领域，尤其涉及一种电动机转轴结构及电动机与负载的连接方法。本发明的电动机转轴结构，包括转轴本体以及芯轴，转轴本体沿其中心轴线开有贯通的中心孔；芯轴与转轴本体同轴线的布置在转轴本体的中心孔内；芯轴还与负载转轴同轴对接。本发明的电动机与负载的连接方法，转轴本体用于旋转运动；芯轴用于传递扭矩；径向间隙用于补偿电动机转轴与负载转轴连接的安装误差。本发明的电动机转轴结构及电动机与负载的连接方法，转动运动与扭矩的分开传递，借助芯轴的细长结构特点以及芯轴与转轴本体之间的径向间隙，实现了电动机转轴与负载转轴连接的安装误差的补偿，且传动可靠，使用寿命远远大于联轴器连接的使用寿命。