本发明提供了一组用于检测沙门氏菌的分子靶标，所述分子靶标包括如SEQ ID NO.1～13所示的核苷酸序列。本发明还提供例了一组用于检测如权利要求1所述的用于检测沙门氏菌分子靶标的引物，其核苷酸序列如SEQ IDNO.14～39所示。采用本发明的引物针对特异性靶标进行PCR扩增，通过检测扩增产物是否含有目的条带判定样品中是否含有沙门氏菌，该方法降低了检测成本，更加具有实用性；本发明的特异性分子靶标即13个保守核酸具有单一的特异性，检测结果特异，结果判定简单。